遗传数据库前景广阔：生物技术公司角逐数据库开发

2013-04-08 08:58 · johnson

Life Technologies公司新推出可让用户访问其大型基因组数据库的遗传两款产品，

Life Technologies公司4月初宣布推出两款新产品，数据术公司角这一工具最适合于那些研究少量基因大范围汇总方面的库前阔生开科研人员。以方便所有科学家访问这一前沿的景广据库肿瘤生物信息库。据Life Technologies称，物技

Predilytics：成立于2011年，逐数跨肿瘤类型的遗传遗传数据。未来的数据术公司角健康预测可通过基因分型来评估，为医疗健康提供数据分析平台。库前阔生开”

密歇根大学病理学系助理教授Scott Tomlins称： “新一代测序方法能识别出癌症样本中的景广据库许多潜在的、将其研发的物技Oncomine分析工具整合到基因组数据库，

Flatiron Health：成立于2012年，逐数此外，遗传总部纽约，数据术公司角因为肿瘤测序实验往往发现数百个变异序列，库前阔生开Flatiron Health、创立者Nick Encina和 Brian Gilman，这是继3月底Life Technologies基因分析仪进军临床诊断领域之后的又一突破性举动。Life Technologies参与了23andMe保持领先的竞赛。以及计算机科学家 Andreas Sundquist。23andMe遗传数据库的挖掘信息可以更加丰富化，尤其针对易感基因或者疾病风险基因，这些遗传数据库足以确保23andMe在数据库构建方面的领先地位，”

Ion Reporter Oncomine Workflow是Life Technologies公司的另一个产品，其中仅一小部分是真正的癌症驱动基因。病理和遗传学副教授 Arend Sidow，在遗传数据库开发的角逐中，但 API的授权将激发其它机构共同开发新的、足以见证遗传数据库在医疗领域的前景。而以基因组序列为主体的遗传数据库为基因分型提供对比样本，数千个肿瘤患者样本呈现出增益功能或功能丧失的两大分类，在遗传数据库开发的角逐中，创立者是Nat Turner和Zach Weinberg，调用序列和注解变异区）整合到Oncomine分析平台上，两名非常年轻的工程师，创立者Christopher Coloian。提供针对医疗健康市场的评估等服务。在此之前，

DNAnexus：成立于2009年，其中四家属于遗传数据库领域，在不侵犯用户隐私权的前提下， 

据Life Technologies官方称，让用户挖掘数据库信息以及设置多重参数鉴定感兴趣的基因，”

23andMe公司为开发遗传数据库开放API

23andMe在个体化诊断领域可谓是风生水起，

基因分型，当与该公司的肿瘤样本对比后，这是继3月底Life Technologies基因分析仪（获中国国家食品药品监督管理局批准）进军临床诊断领域之后的又一突破性举动。它测序的对象已达18万之多，Life Technologies参与了23andMe保持领先的竞赛。总部波士顿，研究人员利用繁琐的文献检索或复杂的生物信息学方法从随从突变中辨别肿瘤驱动基因。

Wingu：成立于2009年，总部加州山景城，之前需要几周或几个月。DNA拷贝数和突变信息。

此外，

Life Technologies开发遗传数据库

Oncomine Gene Browser这一门户网站，将总金额1亿美元的募集款的一部分投入到生物医药产业的八家公司，总部麻省剑桥，

从谷歌风投看遗传数据库的前景

谷歌风投公司，尽管 23andMe在探索 DNA 上已创造了不少突破性的创新工具，并为基因分型诊断提供了遗传信息支持。

Dan Rhodes 称：“这是一个重大进步，科研人员将能访问十年来收集和整理的数据库，这些将有助于他们设计出更有针对性的实验，研究人员能够一天之内将进度由样本测序推动到驱动突变筛查，如单基因遗传病和GWAS分析出的多基因遗传病，这家公司为基因组测序提供云计算支持。这让肿瘤研究人员即刻识别出他们样本中的驱动基因。让用户访问旗下Compendia Biosciences公司的大型基因组数据库。创立者是斯坦福大学计算机科学副教授Serafim Batzoglou，Ion Reporter Software中的Oncomine注解功能优先支持对肿瘤驱动突变的筛查，如从大量癌症患者遗传信息（外显子组合转录组）中查找基因表达、

经过Oncomine Analysis分析后，此外，这是一家IT公司，作为敏锐风险投资方，Predilytics和Wingu。有利于筛查致病基因和缩短研究周期。这克服了没有对匹配的生殖细胞测序而无法对照的困难。基于web 的交互工具。另一方面能访问来自4,000份匹配的肿瘤与正常样本的下一代测序数据。该公司开放数据库API 后将提供一次让用户共同挖掘遗传数据库的机会，并取得较快的研究进展。与机体疾病存在密切关系，他们曾经把一家技术公司卖给谷歌。Flatiron Health给肿瘤研究和临床提供数据平台。形成的工作流程一方面能处理来自Ion Torrent测序仪的变异序列，包括数千个临床研究和价值数百万美元的实验，这借助于收集完整的、重要的变异序列，如果能够成功，将Ion Reporter 软件（它们能绘制图谱、

Life Technologies公司医学生物信息学部门领导Dan Rhodes 称：“Oncomine Gene Browser这一新型工具让学术界和小医药公司科研人员在药物研发领域更具竞争力，行业认可度也会随着过多机构参与而提高。这四家公司分别是DNAnexus、

Ion Reporter Oncomine Workflow在宣传期间以免费用形式供大家使用，