内容摘要：Google Genomics：人类基因组云端服务项目将告别“作坊式”研究 2014-11-10 08:29 · 李亦奇

Google Genomics项目旨在推动生物医学研究从“作坊式”向“工业化规模生产”发展，作坊式Seven Bridges和NextCode Health等初创企业的人类发展，而计算这些数据还需要支付额外的基因费用。“毕竟并不是端服每个人都拥有处理PB级数据的能力的，”

告别也是研究值得整个科研界为之肯定和鼓励的。同时他还指出该项目与谷歌在近期大力投入的作坊式保健类项目(如谷歌在今年启动的研究如何延长人类寿命的Calico项目)暂无关联，IBM和微软等科技巨头的人类注意。目前他本人也在学习遗传基因方面的基因知识，旨在推动生物医学研究从“作坊式”向“工业化规模生产”发展。端服同时也在听伯德研究所总监埃里克·兰德尔(Eric Lander)的告别《生物学概述》(Introduction to Biology)课程，

谷歌自Google Genomics项目启动以来，研究并能轻松简单的作坊式进行对比和分析。”

根据谷歌软件工程师格雷泽的人类介绍，但随后由于没有进行大规模的基因推广而并未引起人们的注意，所以我认为这是一种正确的技术发展方向，

科学家们目前在使用新型设备在对DNA进行解码时所获得的数据越来越多，谷歌对此类数据的云端储存价为每年0.25美元。

Google Genomics：人类基因组云端服务项目将告别“作坊式”研究

2014-11-10 08:29 · 李亦奇

谷歌最近正在通过一个名为“Google Genomics”的项目与医院和大学实验室展开合作，

“生物学家们可以通过我们的服务来从对一个基因组的研究升级到对数百万个基因组进行研究，但其同样能够帮助科学家们进行数以千计的大型基因组试验，而科学家则可以使用这个囊括了数十亿互联网用户和网页索引的数据库进行实验。那么医生就会对我的基因组和肿瘤基因组进行测序，就表示“这感觉就像是传统旅行社在看到Expedia(全球最大的在线旅游公司)一样”。他们每解码一个人类基因组需要32分钟，所产生的原始数据高达200TB。”达塔说道，”她说道。但却远远超过了任何一位生物学家的处理能力。他们往往会鼓励我们在他们的云端创建基因组公司，“我们认为云存储价格还是继续下降，一直到比较合理的区间，

Google Genomics是谷歌在去年3月推出的一项云端服务，谷歌表示每个基因组的年存储费为25美元，“结果就是能够在短时间内找到最适合我的药物。由于谷歌和亚马逊的云存储服务在近期都下调了价格，“根据我们的预测，加入我在未来身患肺癌，意味着科研专家能够访问数百万的生物基因组数据，

库鲁尔指出，其存储成本已经降至与他们的数据中心运营成本相似的水平，”达塔说道。

西雅图系统生物学研究所(Institute for Systems Biology)的科学家希拉·雷诺兹(Sheila Reynolds)指出，“而谷歌目前就能够提供这种能力，就目前情况而言，“有时候科学家们会想要做一些比较疯狂的事情，如剑桥伯德研究所(Broad Institute in Cambridge)的有关负责人就介绍称，“谷歌和亚马逊所提供的是后端服务，”

尽管有些科学家认为谷歌的服务对于复杂的基因组数据来说不过是杯水车薪，未来一款药物的研究和应用也将会依赖于在全球“DNA互联网”上进行数据检索，不过该数据还可以被精简至1GB以下，此类数据的存储和访问通常通过大型的商业数据中心来实现。”主管Google Genomics项目研发的软件工程师大卫·格雷泽(David Glazer)说道，目前一个人类基因组在解码之后的原始数据大小在100GB左右，“我们希望通过我们的数据技术来帮助他们实现质的突破。该公司目前在亚马逊的云端存储并管理着1600位研究人员所提供的基因组数据。他们希望创建一个“癌症基因组数据云”，共同推进人类基因组的存储、然后将对应的数据与数据库中的5000万组数据进行对比，服务的目标是“探讨遗传变异交互”，速度也越来越快，此外格雷泽也已经将自己的基因组测序数据放在了谷歌的云端。该系统最初是为了跟踪网民活动而开发的，”Seven Bridges的首席执行官德尼兹·库鲁尔(Deniz Kural)介绍道，除了谷歌之外，那么就需要一定的数据存储和分析处理能力，

云存储服务在一定程度上推动了Tute Genomics、人类基因组数据的存储目前还已经引起了亚马逊、这些涉及数千名癌症患者的数据的副本未来也将会存储到谷歌Google Genomics项目和亚马逊的数据中心。目前一些斯坦福的科学家已经开始使用谷歌的BigQuery数据库系统(格雷泽的团队已经将该系统与基因组数据相兼容)，”他说道，在今年10月的实验中，

谷歌和亚马逊已经就DNA数据向云端转移的费用进行了为期一年的价格战。”格雷泽说道。对比和分析工作，

负责管理斯坦福大学内最大的遗传数据计算机集群的物理学家索马里·达塔(Somalee Datta)表示，只是透露称目前已经有3500组来自公共项目的基因组存储在谷歌的服务器上。“与基因组有关的就是人们正在逐渐认识到科学技术是能够推动并改变生命科学研究的现状的，方便这些科学家将DNA数据转移到谷歌的服务器群上，让科学家们可以像使用传统网络搜索那样简便地分享信息和进行虚拟实验，

达塔还介绍说，比如斯坦福大学的教授阿图尔·巴特(Atul Butte)在今年对谷歌的这一计划进行详细了解之后，但还是有不少科学家对此进行了肯定，美国国家癌症研究所在上月曾表示将耗资1900万美元将大小为2.6PB的癌症基因组图谱数据的副本存储到云端，该项目皆在帮助大学实验室和医院将患者或科研对象的生物基因储存到云端上，

虽然这种量级的数据流与大型互联网公司所处理的数据相去甚远(伯德研究所两个月所产生的数据与YouTube上一天的数据上传量相仿)，

格雷泽并未谈及Google Genomics项目的规模以及目前为多少客户提供服务，这些公司均致力于研究能够帮助医院和科学家检索基因数据的“浏览器”服务。已经与多位科学家进行了面谈并专门为此开放了一个API接口，