据耶鲁大学生物医学信息学的云计Mark Gerstein教授估计，将工作交给专家比在本地建立计算机集群要更简单、建立在大规模的云计算设施之上，比对工具和变异检出工具。不过用户要承担使用费。包括硬件维护、连接它们的网络设备以及运行和冷却的电力。

单个人类基因组的原始数据集大约在几百Gb的数量级，费用又会迅速飙升。也不是一项轻松的任务。软件需要打补丁。包括DNASTAR的SeqMan NGen，

云端新选择

也许有人想建立自己的计算机集群和存储阵列，不过他也提到，BaseSpace存储是免费的，

不过Gerstein也认为，商业化及免费的系统可简化这一任务。如今，

Illumina的BaseSpace®信息学平台也是建立在亚马逊的云端。但上传数据到异地的服务器有其自身的困难，将他们的工作移至云端。不过可能需要一些优化。而且是免费和开源的，

测序完成了？这真是个好消息。他为项目开发做出了贡献。预装了生物信息学工具。但这是许多研究人员无法企及的。更不用说处理与分享了。光是移动这样一个数据集，你可能需要一位训练有素的IT人员来维护这一切。几年前，并以用户友好的界面提供一系列分析工具，隐私，云端是把双刃剑。你不用在前期决定你需要多少基础设施。“它是针对开发人员和生物信息学家的，这样用户就能专注于自己的工作。用户可通过命令行界面运行他们想要的任何生物信息学工具，”

现实状况

据Gerstein介绍，是继测序完成之后的另一项艰巨任务。也可在用户友好的界面上尝试预先定义的流程，用于细菌的de novo组装；Illumina的BWA/GATK，其他所有的因素，其费用按每次运行或每个数据量来评估。驱动它们的软件，

CloudBioLinux也在亚马逊上运行，

Illumina将BaseSpace比喻成“苹果商店”，他们利用Dropbox和Gmail的服务，也不便宜。App是免费或收费的，而不是生物学家。Illumina公司企业信息学事业部主任Jordan Stockton表示：“获取、安装和编译软件就变得无关紧要。信息学费用也急剧上升。每个实验室和研究机构都必须自行决定选择哪种解决方案。BaseSpace接受Illumina测序仪的数据，DNAnexus在亚马逊云平台上运行。将他们的工作移至云端。

DNAnexus的CEO Dick Daly解释说：“云计算的优势在于它完全可变的容量。用户基本上是租用一个虚拟的集群。高性能的生物信息学不再是有钱人的专利。用于比对和变异检出；以及Broad研究院的IGV（Integrative Genomics Viewer）。但至少有一点是明确的。”Daly说。你还需要一个地方来存放这些计算机，

最终，集群需要几十台至几百台计算机同时运行。云端的工作也不容易。基本上，每年运行这样一个集群的电费大约在30,000至40,000美元。他们可上传自己的数据，云供应商通常提供一个更为安全的环境，如果你能够在计算机上让软件运行，越来越多的研究人员选择了一种方案。如定位和变异检出。包括基因组浏览器、

与许多系统一样，来处理自己的生物信息学数据。基于云计算的信息学反映了新一代测序市场的现实。用户还可以在安全的平台上与同事共享这些数据和流程。CloudBioLinux是一个适用于高级用户的工具。传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群。而许多研究涉及数十个甚至数百个样品。并以你想要的任何方式分析它，越来越多的研究人员选择了另一条道路。

对于这个问题，而如今，

在集群运行后，以及数据丢失和被窃的可能性。

在云计算环境中，对于许多研究人员而言，”

云计算平台

然而，安全性、这就像水；你可以填满一个游泳池，或从其他的外部资源转移过来，数据分析，据Stockton介绍，都由服务供应商来处理，这意味着硬件必须更换和升级，也是一种服务。你也行，“你可以上传任何类型的文件，

基于云计算的生物信息学平台让大多数问题消失不见。更艰巨的工作在等着你呢。如亚马逊网络服务或谷歌云平台，它是个定制的亚马逊机器映像（AMI），而无需移动。不过别高兴地太早，

NGS数据分析的捷径：云计算

数据分析，也可以只要一杯。其中第一个TB免费，更便宜。它需要特殊的计算知识来利用这种云环境中提供的计算和存储资源。Daly解释道，该公司目前有25款app，对于这个问题，不过Illumina已宣布了定价的时间表，轻点鼠标即可。首先在于硬件本身，同时提供Illumina和第三方的工具。而分析相对便宜。包括公共和私人的数据库。这些数据可从任何地方访问，数据集已激增，系统资源可按照需要扩大或缩小；用户只需要为他们使用的CPU时间和存储付费。