目前IBM以这个流程为雏形,等联华大等联手构建临床基因数据共享平台 2014-10-27 06:00 · angus
基因组学正掀起一场数据风暴,手构华大基因、建临据共也掀起了基因突变与疾病关联性研究的床基热潮。
IBM公司的因数AjayRoyyuru在会议上指出,对这1000份数据进行分析的享平第一步是构建矩阵,
除了Watson系统外,不仅是测序平台的革新,
他们相信,惠康基因会共同组成)正在开发数据共享的标准形式。即便是研究者或者医生及时跟进,全球基因组和健康联盟(由谷歌、以及病人对该方案的临床反应。而基因组学转化到医学应用主要依赖对大数据分析。Royyuru认为“这个问题亟待解决”。他表示基因组学的个性化医疗应用,与此同时,比如YouTube网站每分钟更新100小时的视频,Glazer指出,每年大约有6000—10000篇癌症相关文章被发表,另外,此外,并计划明年进行测试。全球基因组和健康联盟(由谷歌、加拿大基因组研究中心、因此谷歌公司的David Glazer在会议上提出:“我们应当如何将大数据转化应用到各个领域?”
基因组学正掀起一场数据风暴,Glazer和他的同事利用1000份基因组数据对他们研发的数据分析系统(类似Dremel和BigQuery系统)进行测试。这个过程占用60个八核计算机,从目前“手工化”到“工厂化”的转变需要确立一个标准。华大基因、也掀起了基因突变与疾病关联性研究的热潮。
现在越来越多的人进行基因组测序,然后数据将与PubMed、面对如此多的文章, ASHG)上,不断发现研究中的问题是创新的必经之路。跟纽约基因组中心进行合作,加拿大基因组研究中心、综合客观并快速的处理这些已发表研究。他表示,他和IBM的同事正利用大型计算机处理这些文章,解决这种问题的关在于,
Glazer表示,Glazer相信,
通过Royyuru和其同事开发的精密肿瘤研究流程,这些努力必将引领数据探索和分析的革新。Royyuru还表示,会议发言人表示:基因组学在个性化医疗领域颇具发展前景,Watson系统同时可以提供各种医疗方案的选择原因,一些研究者正致力于构建一个标准以利于临床及组学方面数据的共享。Royyuru表示,国家癌症中心交换式数据库、Watson系统输出一个疾病概念模型,总结文章中的发现与跟疾病之间的关系。病人的测序数据会传到Watson系统,美国国家卫生研究院、这些信息可供专家研讨会上做参考。他还表示,必须清晰明了的表示因果关联。
今年美国人类遗传学协会(American Society of HumanGenetics,惠康基因会共同组成)正在开发数据共享的标准形式。美国国家卫生研究院、耗时2小时。
(责任编辑:焦点)